干貨|核酸電泳解決方案
凝膠電泳是分子生物學(xué)中鑒定、量化和純化核酸的常用實(shí)驗技術(shù)。瓊脂糖凝膠電泳是分離鑒定和純化核酸片段的標(biāo)準(zhǔn)方法,因其快速便捷和通用性廣,被廣泛應(yīng)用于核酸的分離和分析。
核酸在堿性緩沖液環(huán)境下帶負(fù)電荷,當(dāng)受到電場作用時會通過瓊脂糖凝膠介質(zhì)從負(fù)極(陰極)向正極(陽極)遷移,不同核酸分子片段由于分子和構(gòu)型不同,在電場中的泳動速率也不同,較短的碎片比較長的碎片移動得更快,從而能達(dá)到分離的效果。在凝膠中加入染料,可對分離的核酸進(jìn)行檢測,加入Marker可以相對確定片段的大小。
那么,進(jìn)行核酸電泳實(shí)驗有沒有什么小妙招呢?今天,莫納麗莎就來為大家介紹一下——如何進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的瓊脂糖凝膠電泳操作!滿滿的干貨,為你的實(shí)驗全面助力!
一、準(zhǔn)備工作
在正式開始電泳實(shí)驗之前,首先要進(jìn)行必要的準(zhǔn)備工作:
01明確樣品信息與電泳信息
樣品信息確定DNA樣品或者RNA樣品數(shù)量,片段的大小,濃度;
電泳信息確定膠濃度、制膠大小以及電泳條件。
我們要先根據(jù)所分離片段大小的不同,明確最適宜的瓊脂糖濃度。下表就為大家列出了不同瓊脂糖凝膠濃度所對應(yīng)的線性DNA最佳分辨范圍:
02樣品準(zhǔn)備
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測配制PCR體系,PCR儀上運(yùn)行程序,反應(yīng)完成后取出;
酶切產(chǎn)物檢測配制酶切體系,利用水浴鍋或者金屬浴進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)完成后取出;
總DNA/RNA檢測提取核酸樣品,在DNA樣品或者RNA樣品中加入上樣緩沖液(loading buffer),混勻備用。
03確認(rèn)儀器
確認(rèn)電泳相關(guān)儀器可正常使用,包括水平電泳槽、電泳儀電源等。
二、開始電泳實(shí)驗
01制膠
以制作1%的膠為例,稱取0.5g瓊脂糖加入50ml 1.0×TAE緩沖液,放入微波爐里加熱至瓊脂糖全部熔化,取出搖勻。然后向冷卻至50-60℃的瓊脂糖膠液中加入核酸染料溶液(或者電泳后用染料溶液浸泡染色)。再將瓊脂糖小心倒入膠槽內(nèi),插好梳子(注意保證制膠模具和梳子的潔凈)。
室溫下20~30分鐘后凝膠完全凝結(jié),小心拔出梳子,將凝膠安放在電泳槽內(nèi),向槽內(nèi)加入1.0×TAE稀釋緩沖液至液面恰好沒過膠板上表面。
02上樣
用微量移液槍將樣品小心加入樣品槽中,總體積不可超過樣品槽容量。注意上樣時小心操作,避免損壞凝膠或?qū)悠凡鄣撞磕z刺穿。
03電泳
蓋好電泳上蓋,接通電源,切記DNA樣品由負(fù)極往正極泳動。一般當(dāng)溴酚藍(lán)條帶移動到距凝膠前沿約2cm時,停止電泳。未加染料的膠在電泳完畢后移核酸溶液中,室溫下染色10~30分鐘。
依照核酸片段大小進(jìn)行分離
04凝膠成像與條帶分析
根據(jù)所用染料的不同,我們可選擇不同的凝膠成像光源:藍(lán)光或紫外光。成像后,利用合適的分析軟件進(jìn)行條帶的分析,即可以計算分子量和濃度等信息。
瓊脂糖凝膠電泳成像圖片
縱然每個人都希望得到完美的電泳條帶,但是在實(shí)際的實(shí)驗中還是會遇到各種各樣的問題,導(dǎo)致跑出的結(jié)果不盡人意。
為此,莫納麗莎總結(jié)了一些核酸電泳的常見問題與解決方案,希望可以給到大家一些幫助。以下是不是也有你正在苦苦追尋的答案呢?一起來看看吧!
三、常見問題與解決方案
Q1無條帶或幾乎看不到條帶
Q2條帶拖尾、彌散或分離效果不佳
Q3分離或遷移異常
好了,今天的核酸電泳解決方案就分享到這里啦!不知道大家是否在這篇干貨里找到自己實(shí)驗的影子呢?
歡迎莫粉兒們留言分享自己的實(shí)驗心得與體會,讓我們都在共同得交流學(xué)習(xí)中成為更出色的科研人!
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